[1]李芳,徐良,魏美甜,等.萝卜 IRAP 技术体系建立与品种指纹图谱构建[J].江苏农业学报,2015,(01):143-148.[doi:10.3969/j.issn.1000-4440.2015.01.023]
　LI Fang,XU Liang,WEI Mei-tian,et al.Establishment of inter-retrotransposon amplified polymorphism(IRAP) reaction system and construction of cultivar fingerprint in radish (Raphanus sativus L.)[J].,2015,(01):143-148.[doi:10.3969/j.issn.1000-4440.2015.01.023]
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萝卜 IRAP 技术体系建立与品种指纹图谱构建()
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江苏农业学报[ISSN:1006-6977/CN:61-1281/TN]

卷:
期数:
2015年01期
页码:
143-148
栏目:
园艺
出版日期:
2015-02-28

文章信息/Info

Title:
Establishment of inter-retrotransposon amplified polymorphism(IRAP) reaction system and construction of cultivar fingerprint in radish (Raphanus sativus L.)
作者:
李芳; 徐良; 魏美甜; 龚义勤; 柳李旺
（南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/南京农业大学园艺学院，江苏南京210095）
Author(s):
LI Fang; XU Liang; WEI Mei-tian; GONG Yi-qing; LIU Li-wang
（National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement/College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095，China）
关键词:
萝卜; 逆转座子; IRAP; 指纹图谱
Keywords:
radish; retrotransposon; inter-retrotransposon amplified polymorphism (IRAP); fingerprinting
分类号:
S634.3
DOI:
10.3969/j.issn.1000-4440.2015.01.023
文献标志码:
A
摘要:
为建立萝卜逆转座子间扩增多态性（IRAP）技术体系，基于萝卜Ty1-copia类逆转座子逆转录酶的保守序列设计引物，对IRAP-PCR反应主要因素进行分析。建立的萝卜IRAP标记技术体系（20 μl）为：20 ng 基因组DNA模板，1×PCR buffer，0.25 mmol/L dNTPs，2.0 mmol/L Mg2+，0.4 μmol/L引物，1 U Taq DNA聚合酶。将所建立的IRAP标记技术体系应用于14个萝卜品种指纹图谱分析，结果显示，筛选出的2个特异引物RsTy1F5和RsTy1F10在14份萝卜材料中共扩增得到了16个多态性条带，可以将14份萝卜材料完全区分开，每份种质都有独特的指纹图谱，表明IRAP技术可以有效地应用于萝卜种质鉴定和指纹图谱的构建。
Abstract:
Based on the conserved domain of Ty1-copia-like retrotransposon reverse transcriptase of radish, inter-retrotransposon amplified polymorphism (IRAP) primers were designed. Several important reaction factors of IRAP were studied to establish and optimize IRAP marker system in radish．The IRAP-PCR was performed in a optimized 20-μl reaction mixture containing 20 ng DNA, 1×PCR buffer, 0.25 mmol/L dNTPs, 2.0 mmol/L Mg2+ ,0.4 μmol/L primer and 1 U Taq DNA polymerase. DNA fingerprint maps of 14 radish genotypes were constructed with optimized IRAP molecular marker system. A total of 16 polymorphic bands were generated with two primers, RsTy1F5 and RsTy1F10. The 14 radish genotypes could be absolutely distinguished with the two IRAP primers. Each radish genotype had a unique fingerprint, suggesting that IRAP marker was practical and effective in radish cultivar identification and fingerprint construction.

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2014-05-25 基金项目：国家自然科学基金项目（31372064）；江苏省科技支撑计划项目（BK20140706） 作者简介：李芳(1987-)，女，江苏镇江人，硕士研究生，从事蔬菜作物遗传育种研究。 （Tel）18005289219;（E-mail）lifang191919@126.com 通讯作者：柳李旺，(E-mail)nauliulw@njau.edu.cn
更新日期/Last Update: 2015-02-28