[1]李兆薇,宋阳,徐永福,等.基于微卫星标记的养殖牛蛙群体遗传多样性分析[J].江苏农业学报,2025,(12):2409-2417.[doi:doi:10.3969/j.issn.1000-4440.2025.11.013]
 LI Zhaowei,SONG Yang,XU Yongfu,et al.Analysis of genetic diversity in farmed bullfrogs based on microsatellite markers[J].,2025,(12):2409-2417.[doi:doi:10.3969/j.issn.1000-4440.2025.11.013]
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基于微卫星标记的养殖牛蛙群体遗传多样性分析()

江苏农业学报[ISSN:1006-6977/CN:61-1281/TN]

卷:
期数:
2025年12期
页码:
2409-2417
栏目:
畜牧兽医·水产养殖·益虫饲养
出版日期:
2025-12-31

文章信息/Info

Title:
Analysis of genetic diversity in farmed bullfrogs based on microsatellite markers
作者:
李兆薇1宋阳1徐永福2胡亚洲1华瑞云3王子奥4曹文韬1梁艺馨1王晓清1秦溱1
(1.湖南农业大学水产学院,湖南长沙410128;2.湖南省水产研究所<湖南省水产原种场>,湖南长沙410153;3.湖南雪晖生物科技有限公司,湖南长沙410100;4.湖南生物机电职业技术学院,湖南长沙410127)
Author(s):
LI Zhaowei1SONG Yang1XU Yongfu2HU Yazhou1HUA Ruiyun3WANG Zi’ao4CAO Wentao1LIANG Yixin1WANG Xiaoqing1QIN Qin1
(1.College of Fisheries, Hunan Agricultural University, Changsha 410128, China;2.Hunan Fisheries Research Institute and Aquatic Products Seed Stock Station, Changsha 410153, China;3.Hunan Xuehui Biotechnology Co., Ltd., Changsha 410100, China;4.Hunan Biological and Electromechanical Polytechnic, Changsha 410127, China)
关键词:
牛蛙微卫星遗传多样性遗传分化
Keywords:
Aquarana catesbeianamicrosatellitegenetic diversitygenetic differentiation
分类号:
S966.3+1
DOI:
doi:10.3969/j.issn.1000-4440.2025.11.013
文献标志码:
A
摘要:
为了解中国不同地区牛蛙(Aquarana catesbeiana)养殖群体的遗传结构特点,利用8个多态性较好的微卫星位点,对5个牛蛙养殖群体(湖南省岳阳市湘阴县、湖南省长沙市长沙县、福建省漳州市东山县、广东省湛江市遂溪县、湖北省荆州市监利县)的遗传多样性进行分析。在160个样本中共检测到96.000 0个等位基因,开发的8个微卫星位点中有5个微卫星位点具有高度多态性。5个群体的观测等位基因数(Na)为6.625 0~9.250 0个,有效等位基因数(Ne)为3.351 4~4.525 4个,观测杂合度(Ho)为0.504 2~0.562 5,期望杂合度(He)为0.599 9~0.675 0,多态性信息含量(PIC)为0.564 9~0.649 1,表明各养殖群体均具有较高多态性。5个群体间的遗传分化指数(Fst)为0~0.049 2,基因流(Nm)为4.829 6~9 999.000 0,说明群体间的基因交流频繁。分子方差分析(AMOVA)结果显示,种群间的变异率仅为2%,种群内变异占总变异的98%。由结果可以看出,各牛蛙养殖群体具有较高的遗传多样性,遗传分化水平较低,基因流较大,群体间的遗传距离较近,存在等位基因分布不均、杂合子缺失的情况,若继续进行近缘交配,而不进行科学的良种繁育工作,将存在较大的种质退化风险。
Abstract:
To reveal the genetic structure of cultured bullfrog (Aquarana catesbeiana) populations across different regions of China, we used eight highly polymorphic microsatellite loci to analyse the genetic diversity of five farmed populations from Xiangyin County (Yueyang, Hunan), Changsha County (Changsha, Hunan), Dongshan County (Zhangzhou, Fujian), Suixi County (Zhanjiang, Guangdong) and Jianli County (Jingzhou, Hubei). A total of 96.000 0 alleles were detected in 160 indivi-duals, and five of the eight newly developed microsatellite loci showed high polymorphism. Across the five populations, the mean number of alleles per locus (Na) ranged from 6.625 0 to 9.250 0, effective allele numbers (Ne) from 3.351 4 to 4.525 4, observed heterozygosity (Ho) from 0.504 2 to 0.562 5, expected heterozygosity (He) from 0.599 9 to 0.675 0, and polymorphism information content (PIC) from 0.564 9 to 0.649 1, indicating high polymorphism in all cultured groups. The genetic differentiation index (Fst) among the five populations ranged from 0 to 0.049 2, and gene flow (Nm) estimates varied between 4.829 6 and 9 999.000 0, reflecting frequent gene exchange. Analysis of molecular variance (AMOVA) showed that only 2% of the total genetic variation was attributable to differences among populations, whereas 98% resided within populations. These results demonstrate that the cultured bullfrog populations retain high genetic diversity and low genetic differentiation, with close genetic distances and strong gene flow. Nevertheless, uneven allele distribution and heterozygote deficiency were observed. If inbreeding continues without scientific selective breeding, a substantial risk of germplasm deterioration is expected.

参考文献/References:

[1]马杰,孙菁阳,林翰,等. 广东养殖牛蛙主要细菌病调查及耐药性分析[J]. 现代畜牧科技,2023(7):7-12.
[2]刘生平,吴胜林,兰琼. 江西省牛蛙养殖行业授信策略研究[J]. 黑龙江粮食,2024(2):94-96.
[3]向述辉,朱波,蔡明浪,等. 发酵饲料对牛蛙生长性能、肌肉营养成分及肠道菌群的影响[J]. 动物营养学报,2024,36(10):6643-6655.
[4]宋雪莹. 蛙皮素抗菌肽Caerin 2.1的生物信息分析[J]. 饲料研究,2023,46(24):76-80.
[5]韩俊友,乔红伟,赵瑞利,等. 牛蛙(Rana catesbeiana)蛙皮抗菌肽基因的克隆、测序及其表达[J]. 中国兽医学报,2007,27(3):399-402.
[6]邢根安. 牛蛙的品质特性及贮藏保鲜研究[D]. 重庆:西南大学,2023.
[7]任中阳,黄香兰,崔雅清,等. 复合保鲜剂对冷冻牛蛙保鲜效果的影响[J]. 农产品加工,2023(5):1-5,9.
[8]周海林,曹文韬,王晓清,等. 牛蛙的人工繁殖及蝌蚪培育技术[J]. 当代水产,2024,49(7):74-76,78.
[9]蒙薇. 生态养殖助推牛蛙产业高质量发展[J]. 农村新技术,2024(8):4-7.
[10]马杰. 牛蛙源伊丽莎白菌流行情况、生物学特性及致病性研究[D]. 广州:仲恺农业工程学院,2023.
[11]魏朝宇,汪小冬,魏秀英,等. 5个棘胸蛙养殖群体微卫星遗传多样性分析[J]. 广西师范大学学报(自然科学版),2022,40(6):206-214.
[12]乔芬,邵伟伟,马力,等. 中国虎纹蛙多碱基重复微卫星位点的多态性[J]. 安徽农业科学,2024,52(7):82-86.
[13]吕广祺. 基于微卫星DNA和线粒体COI基因对辽宁地区东北林蛙遗传多样性的研究[D]. 沈阳:沈阳农业大学,2017.
[14]WANG S P, LIU C H, WU J, et al. Propagule pressure and hunting pressure jointly determine genetic evolution in insular populations of a global frog invader[J]. Scientific Reports,2019,9(1):448.
[15]ZHANG J Q, XU C X, WANG S P, et al. Variations in genetic diversity of invasive species Lithobates catesbeianus in China[J]. Animals,2024,14(9):1287.
[16]冯兴浪. 牛蛙风口,是商机还是 “伤机”[J]. 当代水产,2022,47(11):79-81.
[17]张淇浩. 基于转录组解析的杂交云龙石斑鱼生长优势的分子机制研究[D]. 舟山:浙江海洋大学,2023.
[18]欧阳苗峰,陈红林,刘峰,等. 红螯螯虾不同养殖群体和选育群体遗传多样性及遗传结构分析[J]. 农业生物技术学报,2024,32(9):2112-2123.
[19]范嗣刚,黄皓,王鹏飞,等. 基于微卫星标记的花鲈亲子鉴定技术[J]. 广东海洋大学学报,2023,43(5):26-33.
[20]苏胜彦,张林兵,李海洋,等. 基于微卫星标记的大口黑鲈(Micropterus salmoides)原种和养殖群体遗传多样性和结构分析[J]. 浙江大学学报(农业与生命科学版),2020,46(6):687-698.
[21]张敏莹,方弟安,周彦锋,等. 基于SSR标记的钱塘江中下游三角鲂4个放流苗种群体遗传多样性和遗传结构检测[J]. 中国农学通报,2024,40(13):157-164.
[22]崔学海,沙航,曹继增,等. 克氏原螯虾湖北7个养殖群体遗传多样性的SSR分析[J]. 淡水渔业,2024,54(6):79-86.
[23]刘志刚,高风英,佟延南,等. 尼罗罗非鱼生长性状相关微卫星标记的筛选与验证[J]. 大连海洋大学学报,2023,38(6):925-934.
[24]王亚军. 鲢微卫星标记开发及湖北养殖群体遗传多样性分析[D]. 荆州:长江大学,2023.
[25]陈波,李美华. 牛蛙养殖技术与注意事项[J]. 湖南农业,2024(4):23.
[26]朱传炳,王瑛. 牛蛙(Rana catesbeiana)染色体研究[J]. 激光生物学报,2006(3):305-307.
[27]王晓清,綦志仁,江辉,等. 雌雄牛蛙器官组织LDH同工酶初步研究[J]. 水利渔业,2005,25(4):7-8,12.
[28]周静. 乳酸脱氢酶的分离纯化及其性质的研究[J]. 赤峰学院学报(自然科学版),2009,25(9):111-113.
[29]陈祺楷. 湖北、四川、广东地区牛蛙脑膜炎样传染病病原分析[D]. 武汉:华中农业大学,2024.
[30]胡玉婷,凌俊,江河,等. 苏皖地区中华绒螯蟹养殖群体微卫星遗传多样性的评估[J]. 渔业科学进展,2024,45(6):178-187.
[31]潘秋芝. 斑鳜微卫星标记开发及其遗传多样性评价[D]. 贵阳:贵州大学,2022.
[32]陈薇薇,幸宁. 雪胆属转录组的EST-SSR分子标记开发[J]. 安徽农业科学,2023,51(9):160-163.
[33]向天翼. 托木尔峰野生赤狐遗传多样性及肠道菌群结构[D]. 阿拉尔:塔里木大学,2023.
[34]EVANNO G, REGNAUT S, GOUDET J. Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE:a simulation study[J]. Molecular Ecology,2005,14(8):2611-2620.
[35]陈文淳,彭凯,黄敏伟,等. 基于SSR标记分析15个凡纳滨对虾家系遗传多样性和遗传结构[J]. 生物工程学报,2024,40(12):4628-4644.
[36]闫春梅,郑伟,高春山,等. 基于微卫星标记的图们江大麻哈鱼遗传多样性分析[J]. 水产学杂志,2021,34(5):1-7.
[37]黄新芯. 龙头鱼微卫星标记开发及群体遗传多样性研究[D]. 舟山:浙江海洋大学,2022.
[38]张帝. 不同大口黑鲈群体生长性能、营养价值和遗传多样性研究[D]. 南京:南京农业大学,2022.
[39]吉钰,陈再忠,温彬,等. 野生型和人工选育全蓝型七彩神仙鱼群体的遗传多样性分析[J]. 广东农业科学,2024,51(4):65-78.
[40]WEIR B S, CLARK C C. Estimating f-statistics for the analysis of population structure[J]. International Journal of Organic Evolution,1984,38(6):1358-1370.
[41]池炳杰,常玉梅,闫学春,等. 瓦氏雅罗鱼达里湖群体和乌苏里江群体的遗传多样性和遗传结构分析[J]. 中国水产科学,2010,17(2):228-235.
[42]吴贵清,李瑞华,肖意豪,等. 基于微卫星标记9个缢蛏群体的遗传多样性分析[J]. 热带海洋学报,2025,44(2):124-136.
[43]张瑞,郎侠,吴建平,等. 岷县黑裘皮羊微卫星遗传多样性分析[J]. 中国畜牧兽医,2019,46(8):2360-2370.
[44]周梦晨,徐东坡,方弟安,等. 6个不同群体鳜基于SSR的遗传多样性初步研究[J]. 中国农学通报,2020,36(26):147-152.
[45]BALLOUX F, LUGON-MOULIN N. The estimation of population differentiation with microsatellite markers[J]. Molecular Ecology,2002,11(2):155-165.
[46]黄皓,范嗣刚,王鹏飞,等. 基于微卫星标记对6个花鲈群体的遗传多样性分析[J]. 南方水产科学,2022,18(1):99-106.
[47]冯兴浪,李军华,刘小燕. 产值规模冲刺千亿!关于牛蛙的繁育,掌握这几点事半功倍[J]. 当代水产,2023,48(2):73-76.
[48]陈莉莉. 产值600亿~800亿!如今牛蛙养殖遍地开花,从业者:先求生存,后谋发展!2023行情如何[J]. 当代水产,2023,48(1):39-41.

相似文献/References:

[1]庞有志,白俊艳,张小辉,等.北京白羽鹌鹑微卫星多态性分析[J].江苏农业学报,2015,(05):1110.[doi:doi:10.3969/j.issn.1000-4440.2015.05.026]
 PANG You-zhi,BAI Jun-yan,ZHANG Xiao-hui,et al.Polymorphism analysis of microsatellite marker of Beijing white-feather quail[J].,2015,(12):1110.[doi:doi:10.3969/j.issn.1000-4440.2015.05.026]

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期:2025-06-30基金项目:湖南省种业创新项目(2023);湖南农业科技创新基金项目(2025CX52)作者简介:李兆薇(1999-),女,山东邹城人,硕士,研究方向为水产动物遗传育种。(E-mail)610546934@qq.com通讯作者:王晓清,(E-mail)wangxiao8258@126.com
更新日期/Last Update: 2026-01-20