[1]郝爱平.高粱查尔酮合成酶的生物信息学分析[J].江苏农业学报,2016,(06):1232-1236.[doi:doi:10.3969/j.issn.1000-4440.2016.06.006]
　HAO Ai-ping.Bioinformatics analysis of chalcone synthase in Sorghum bicolor[J].,2016,(06):1232-1236.[doi:doi:10.3969/j.issn.1000-4440.2016.06.006]
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高粱查尔酮合成酶的生物信息学分析()
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江苏农业学报[ISSN:1006-6977/CN:61-1281/TN]

卷:
期数:
2016年06期
页码:
1232-1236
栏目:
遗传育种·生理生化
出版日期:
2017-02-07

文章信息/Info

Title:
Bioinformatics analysis of chalcone synthase in Sorghum bicolor
作者:
郝爱平
（牡丹江师范学院生命科学与技术学院，黑龙江牡丹江157012）
Author(s):
HAO Ai-ping
（College of Life Sciences and Technology, Mudanjiang Normal College, Mudanjiang 157012, China）
关键词:
高粱; 查尔酮合成酶; 生物信息学
Keywords:
Sorghum bicolor; chalcone synthase; bioinformatics
分类号:
S514.01
DOI:
doi:10.3969/j.issn.1000-4440.2016.06.006
文献标志码:
A
摘要:
为研究高粱查尔酮合成酶（CHS）基因的功能，利用生物信息学工具和方法，对CHS蛋白质理化性质、疏水性/亲水性、跨膜区域、结构功能域、二级结构、三级结构和同源性进行了预测与分析。结果显示，高粱的CHS蛋白质共有8种（CHS1~CHS8），其氨基酸数量都在400左右，分子量差别不大；其中CHS1~CHS7为较稳定的亲水性蛋白质，CHS8为不稳定的疏水性蛋白质；8种蛋白质都为非跨膜蛋白。CHS蛋白有Chal_sti_synt_N和ACP_syn_lll_C 2个结构域，主要构件为α-螺旋和不规则卷曲。同源性分析结果表明，CHS1~CHS7蛋白质氨基酸序列间的同源性较高。
Abstract:
To obtain more information about chalcone synthase (CHS) gene from Sorghum bicolor, the bioinformatics methods and tools were used to analysis the physical and chemical properties, hydrophobic/hydrophilic, transmenbranne region, structure and function domain, secondary structure， tertiary structure and homology of CHS protein in Sorghum bicolor. The results showed that there were eight CHS proteins in Sorghum bicolor (CHS1-CHS8). The number of amino acids was about 400 in CHS proteins. All CHS proteins were stable and hydrophilic protein except for CHS8. The analysis also demonstrated that the eight CHS proteins were non-transmembrane protein. Its main component was alpha-helix and random coil. The structure domains of CHS proteins consisted of Chal_sti_synt_N and ACP_syn_lll_C. The sequence homology was higher in CHS1-CHS7 proteins.

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2016-03-16 基金项目：牡丹江师范学院教学名师培养资助项目（2014QNGG1805）；牡丹江市科学技术计划项目（G2015d1974） 作者简介：郝爱平(1979-)，女，山东莘县人，硕士，副教授，研究方向为分子生物学。（E-mail）swxhap@126.com
更新日期/Last Update: 2017-02-07